服务热线:QQ 注册/登录

技术资料

当前位置:AG娱乐手机官方网站生物 > 新闻资讯 > 技术资料 >

如何做蛋白亚细胞定位实验?

发布时间:2020-05-29 09:50 作者:admin 来源:未知 点击: 字号:

 

生物功能的区域化是生命的一种基本现象,这种区域化是通过不同层次的系统组成,从器官到特异细胞,再到细胞内部的亚细胞结构,最后到大分子复合物。在细胞水平,蛋白在特定的时间和空间发挥作用,这种区域化的定位为蛋白发挥作用提供特定的化学环境以及所需的互作因子等。蛋白的错误定位容易导致细胞活动的紊乱。因此,了解蛋白的亚细胞定位对于研究基因的功能、蛋白互作及其作用机理是必要的。

 
 

  

Fig. 人体细胞内的亚细胞结构。Peter J. Thul et al., Nature. 2017.

 

 
研究蛋白亚细胞定位的方法有哪些?
1、计算机预测,可使用UniProt数据库(https://www.uniprot.org/)
 
2、荧光蛋白原位鉴定
 
3、免疫荧光标记
 
4、定量色谱,可以鉴定细胞内在梯度电泳中分布相似的或通过酶切处理标记的蛋白

小编推荐第二种方法,是近年来分子生物学实验最常用的方法之一,下面我们来看看方法二吧!
 
概念是什么?

采用瞬时转化技术,利用激光共聚焦显微镜(Confocal microscopy)观测某种蛋白在细胞内的具体位置,例如在细胞核内、细胞质内、细胞膜或细胞器上。

 

 
原理是什么?

将目标基因与荧光蛋白的N端或者C端融合,通过瞬时转化技术使该融合蛋白在受体材料细胞内表达,通过观察荧光蛋白在细胞内显示的位置确定目标蛋白的位置,从而确定目标蛋白的亚细胞定位情况。

 

 
适用于什么实验场景?

1基因功能研究,paper里总少不了这一项

2研究蛋白相互作用,与酵母双杂实验结果相互验证
同时2有个单独的名字——双分子荧光互补技术(Bimolecular fluorescence complementation,简称BiFC),将荧光蛋白分割成两个不具有荧光活性的分子片段,再分别与目标蛋白连接。若两个目标蛋白因为有相互作用而接近,就使得荧光蛋白的两个分子片段在空间上相互靠近,重新形成活性的荧光基团而发出荧光。

 


Fig. BiFC原理图

 
实验方法

按实验材料的不同分为三类:

一、原生质体

 


构建载体→制作原生质体+转化质粒激光共聚焦显微镜观察

二、烟草叶片

构建载体-农杆菌转化-注射烟草叶片-激光共聚焦显微镜观察

三、动物细胞

构建载体-转化质粒-激光共聚焦显微镜观察

敲黑板 划重点:共定位实验,一定要选用文献已发表的做过亚细胞定位的蛋白作为对照哦!

 

 
常见的问题

原生质体转化效率低,需要注意水浴的温度,适宜的温度可以起到事半功倍的作用。

烟草瞬时转化常见的问题:

1转化效率低:需注意农杆菌的活性,建议侵染烟草叶片的农杆菌OD600值为0.6;

2生长4-5周的烟草苗比较适合注射。

原生质体瞬时转化的注意事项:

1原生质体非常脆弱敏感,操作需轻缓,环境培养温度要求严苛;

2W5溶液是维持细胞渗透压最关键的溶液:浓度过高,细胞会瘪;浓度过低,细胞会破;

3W5溶液的最适为pH5.7-5.8;

4苗龄过高或育苗时水分不足会产生较多的淀粉粒;

5. 细胞经过多次洗涤,在洗涤转移上清液时,枪头要从上部轻轻吸取,尽量减少细胞震荡,避免细胞损失。

亚细胞定位不亮的原因(相对于老师自己寄送材料而言):

1. 质粒问题:质粒浓度不够;质粒已降解;空载体自身的转化效率不高;

2目的蛋白和荧光蛋白的相对位置;

3载体构建问题:所构建的载体中荧光蛋白是否移码;目标基因是否去除终止密码子(gene-GFP);目标基因是否包含ATG启动子(GFP-gene);

4物种差异;

5目标蛋白空间折叠的问题,如果目标蛋白较大会将荧光蛋白包裹起来,建议用Linker隔开;

6有些目的蛋白包含信号肽,若构建荧光蛋白-目的蛋白的形式,是会影响定位情况或直接导致没有荧光。

 

 
我们公司的技术优势

成熟的单双子叶原生质体瞬时转化平台
无缝连接排除非必要序列干扰
拥有全套各色细胞器Maker
低质粒浓度的高效转化
稳定,可重复性高
高分辨、高质量图片结果
快速、高效,我司拥有自行购置的Confocal仪器,每年做至少三千个项目,一周之内可看结

 

 
能做哪些材料

植物:我司常备水稻、烟草、小麦、大麦、玉米、拟南芥的原生质体、烟草叶片

有以下细胞器的Marker细胞核,质膜,液泡膜,内质网,高尔基体,过氧化物酶体,叶绿体,线粒体

可选荧光蛋白:GFP,YFP,mCherry,mKate

 

动物:我司常备293T细胞、Hela细胞,其他细胞也可。

有以下细胞器的Marker:细胞核、线粒体、细胞膜、内质网、高尔基体、过氧化物酶体

可选荧光蛋白:绿色和红色荧光

 

 
AG娱乐手机官方网站案例

AG娱乐手机官方网站生物植物亚细胞定位


AG娱乐手机官方网站生物动物亚细胞

相关文章Related Articles

  • 如何做蛋白亚细胞定位实验

    2020-05-29

    生物功能的区域化是生命的一种基本现象,这种区域化是通过不同层次的系统组成,从器官到特异细胞,再到细胞内部的亚细胞结构,最后到大分子复合物...

  • p值、n值…晕了没?

    2020-05-29

    P值 P值常见于转录组、蛋白组组学数据中。 P0.05,是不是觉得很眼熟, 灵魂拷问P0.05到底表示啥? 先来了解一下两个概念 原假设 (或零假设,null hypothe...

  • 近期文献集锦

    2020-05-29

    自从人类基因组计划以来,各种物种的基因组序列被相继公布,后面的工作就是在海量的基因组数据中去研究其基因的具体功能。这其中包括了蛋白的功能...

  • 如何做双荧光素酶实验?

    2020-05-29

    ...

如果您觉得本站还不错,就请分享给身边的好友吧


分享成功还有机会获得精美礼品哦

拨打电话